1.大数据人工智能、基因组测序时代下的行为生态学研究

采用大数据人工智能、（基因）组学分析以及社会网络分析等（Social Network Analysis）最新方法和手段，开展新时代行为生态学研究。在达尔文性选择（Sexual Selection）和经典行为生态学理论框架下，结合全球环境变化背景、以中国特色鸟类物种为研究对象，从行为学角度揭示物种形成与濒危机制, 以及全球变化背景下野生动物适应策略。力图阐明当今全球环境变化对动物分布及演化的影响及栖息地破碎化下动物濒危和灭绝机制，从生态学和遗传学两方面揭示物种濒危和种群衰退的近因和远因及其保护对策。

2.种群数量遗传与进化学研究

在全球气候剧烈变化的背景下，监测和揭示气候变化（长期尺度）对野生动物的深度影响以及其响应机制。瞄准“动物复杂性状和基因组学解析”这一重大科学问题。关注一个种群重要行为、繁殖参数以及重要表型性状的遗传进化机制。采用数量遗传学的方法，来计算重要表型的可遗传程度。进一步采用基因组生物信息学方法通过全基因组关联分析（GWAS）来确定该重要表型的遗传进化机制。

3.系统比较生物学研究

通过系统比较生物学（comparative studies）的方法，对动物重要生活史特征进行演化和溯组分析，来揭示其生态环境限制因子和其他重要生活史特征的关联，推断其进化历史以及发展趋势。解答“动物多样性格局和类群进化模式”这一重大科学问题。